在一片欢呼声中，李自成回到了衡州。
衡州现在已经成为了整个华南地区的中心。这里位于长沙、赣州、广州、桂林四个省会之间的交通要道上，又有现成的桂王府作为办公地点。再加上这里被闯军占领之后从来没有放弃过，又经过了衡州之战，人心最稳定，因此作为闯军的行政中心是最合适的。
李自成也不是没想过要把根据地放在更稳妥的地方，比如说桂林、梧州、肇庆或者广州。但是他不愿意把根据地放在南岭以南，那样的话，偏安的氛围太过浓厚。
还有一个原因是，岭南地区除了桂林有靖江王府之外，梧、肇、广三城都没有合适的办公地点，李自成又不想新建帅府，所以只能拣有明朝藩王的城市。
广州是目前闯军控制的最大的城市，但是李自成嫌它太过繁华，担心兄弟们进驻广州之后消磨斗志。把王瑾、李过、高一功这仨清心寡欲的圣人放在那里，李自成还比较放心，至于别人，他可就不太信得过了。帅府还是设在衡州这个中型城市比较好，既有足够的规模，又不至于让兄弟们沉湎于享受。而且衡州在湘江之畔，是从两广北伐的必经之路，在衡州建政，也可以表明闯军未来有争夺天下的意向。
闯军的地盘扩张得太过迅速，因此引发的问题也层出不穷。十万大军看起来很多，然而分散到四省之后，各地兵力都显得不足，官吏队伍更是捉襟见肘。在两广和江西的很多地方，根本来不及对投降的官绅胥吏进行仔细甄别，只能除了几个恶名昭彰的之外都一股脑地接收下来，以后再慢慢调查，这无疑会留下非常大的隐患。
在两广，除了一些原有社会秩序被摧毁的受灾地区之外，田兵组织的发展几乎停顿了，因为实在是没有那么多人去组织老百姓。在井冈山一隅之地行之有效的政策，在如此广大的区域推广可就水土不服了。王瑾是田兵制度的“发明”者，但也是他最先提出田兵的推广要缓之又缓。
一税四租的政策还是要推广的，闯军现在政权建设的首要任务是整顿税吏队伍，终止明朝的加派之害。朝廷的征税额度并不要紧，关键是征税过程中官吏和包税人对百姓的侵害。至于地租的额度，没有田兵组织，很难保证是否执行下去。因此闯军暂时先采用“三年不退佃”的方式，三年之内，官府不受理退佃的纠纷。至于三年后怎么样，到时候再说吧。
但是，因为闯军的到来，很多原本就在进行抗租运动的农民，和赣南的农民一样，自发建立了自己的田兵组织。参加者基本上都是原本在宗族中地位低下的人，成为了又一支重要力量。
在政治和经济上，新政权的建立十分艰难，但是在军事上，闯军高歌猛进的速度实在惊人。新年刚过，王瑾和刘宗敏便对两广的残余明军发动了攻击。
岭南的初春对于闯军来说是十分宜人的气候，既没有像北方那样的酷寒，又没有恼人的雨水。这对于闯军的行军、运输和健康来说，都十分有利。
在广西，陈邦傅的军队根本不堪一击。而且刘宗敏只是因过去杀良冒功之罪不许陈邦傅本人投降，又没不许陈邦傅的部下投降。不到一个月的时间，陈部便全部瓦解。陈邦傅本人失踪，不知死活。
广西所有流官地区全部被闯军占领，至于土司控制区，只要他们不与闯军为敌，就暂时保持现状。可以不公开承认闯军，但是要互派使者，允许商人往来。
广东因为财政更宽裕，所以军队更多一些，目前王瑾部面对的对手除了肇庆的陈谦之外，还有惠州参将严遵诰、潮州参将童以振、雷廉参将赵千驷、琼崖参将汤允文、东山参将何吾嶷、西山参将朱家臣、海防参将黎延庆，一共七个参将。但是这七位实在没有一个能打的，都是在历史上被李成栋甚至阎可义碾压的。
黎延庆的兵都是水师，陆战能力不如土匪，海战能力其实也不如海贼，广州一失守他就降了。李过、田虎、马重僖三营进军肇庆，刘芳亮也从背后夹击，陈谦眼见不敌，竟弃军私逃，下落不明，全军数千之众除逃散者外都做了俘虏。紧接着，已经在和瑶民的战斗中伤亡不少的东山参将何吾嶷所部也献出罗定州投降。
西山参将朱家臣正应了他的名字，是朱明的死忠，但他拗不过军心。军无战心，下级军官和士兵都不想和闯军拼命，他也没有办法。最终他只能弃军逃入了深山，落发为僧。
赵千驷直接投降了，他的辖区在粤西一角，陈邦傅一完蛋，他无路可走，要么投降，要么去投奔越南。如果对手是大清，他倒是真的有可能这么选，毕竟越南人和大明用的是一样的衣冠，一样的文字。不过既然来的是闯军，那就不存在这个问题了。
严遵诰试图抵抗，但惠州离广州太近，还有水路连通，何况他军队的驻地都集中在惠州府北部，难以增援府城，实在没法守。要撤到潮州去，童以振又不欢迎他。严遵诰逃跑至兴宁县，兵马逃散大半，思来想去还是投降了。
闯军既不是北方的鞑子，也不是海外的洋夷，他们采用的制度虽然自成体系，但也脱胎于大明。明朝的旧军人在这个体系有容身之地，既不会被当成阶级敌人排斥出政权，又不用剃发易服。既然如此，那就没什么不能谈的了。
童以振因为背靠福建，所以还有一些胆气，和高一功、王文耀在揭阳县打了一仗，兵马折去大半。高一功派严遵诰劝降，童以振无奈，只得献出潮州府城降闯。
最后只剩下控制琼州府的汤允文了，琼州海峡的阻隔给了他一定的安全感。然而这道海峡还是不够宽，而且汤允文部水师的战斗力也称不上多强。闯军集中了其他投降的广东水师的船只，再加上征调民船，很快就凑起了足够运送一营闯军过江的船只。马重僖部带头横渡，闯军刚一登岸，汤允文就知道打不赢了。
他本想跑路去福建，但又想到自己和郑芝龙没什么交情，而且对于自己的破船的远程航行能力信不过，走近海，怕被闯军截住，走外海，又容易出事故。思来想去，还是直接投降最安全。
严遵诰、童以振、赵千驷都授予副果毅将军将军之职，四品级别，作为闯军各营主将的副手随在军中。何吾嶷有铸炮的经验，改任广东工官，汤允文、黎延庆去参与水师筹备。投降的明军分为三部分，老弱直接裁汰，精壮打散补充进闯军野战部队，其余一般的士兵与闯军老兄弟混编之后作为地方卫戍部队。
各地士绅的抵抗颇多，但是和自杀无甚区别。这些人根本不了解闯军的实力，贸然带着乡勇没头没脑地反抗，都被轻易剿灭了。但肯定也会有不少乖觉之人潜伏下来。鉴于另一时空的教训，王瑾在防叛乱问题上花了大力气，但究竟成效如何，也只能靠时间来检验了。