而另一个配享文庙的，是孔子的八世孙孔鲋。
孔鲋，字子鱼，他的父亲孔谦曾经是魏国的相国，魏国灭亡之后，秦始皇封其为文通君，与魏国遗民张耳、陈余相善。
陈余得知秦始皇焚书之议后，急忙通知了孔鲋。孔鲋冒着生命危险，将《论语》《孝经》《尚书》《礼经》等书籍藏在了孔子故居的墙壁中，使其躲过了这场浩劫。孔鲋自己则藏身嵩山之中，教授弟子百余人，以求传续儒家学脉。
大泽乡起义之后，孔鲋在曹咎的引荐下带着礼器投奔了张楚，被任命为太师。孔鲋建议陈胜封二王三恪和六国后人为王，又认为周文能力不足，过于冒进。后来的周文之死和项梁立熊心为号召，证明孔鲋的想法是对的。遗憾的是，陈胜认为孔鲋这样的儒者“可与守成，难与进取”，虽然对待他很客气，但只让他主管文教、礼乐、祭祀，对他的计策一条也没有采纳。
后来，周文为章邯所破，陈胜被叛徒刺杀，张楚灭亡，虽然陈胜没能让孔鲋实现理想，但孔鲋还是决定以身殉之，他遣散了自己的弟子，让他们去鲁地避难，自己留在了陈县，终为秦兵所杀。
陈胜虽死，其志不灭，陈胜侍从出身的吕臣组织“苍头军”，很快收复陈县，处决杀害陈胜的叛徒庄贾，另一个张楚旧部召平则请来了项梁。孔鲋的侄子孔藂投奔刘邦，南征北战多年，最终跟着刘邦占领咸阳，灭亡秦朝，后来成为西汉的开国功臣之一。
孔鲋牺牲之后，没人知道他所藏书籍的下落。于是这些古书尘封数十年，直到汉武帝时期，封在曲阜的鲁王刘余要扩建王府，拆除孔子故居，这才在夹壁中发现了这些书。
闯军是不可能抛弃“儒”的旗号的，如果要在儒者中选一个人来推崇，孔鲋显然是最合适的人选。他是历代帝王都祭祀的正面人物，有孔氏嫡派传人的身份，祭祀他不会有太大的阻力，而他为对抗暴秦投奔农民军，最终身殉张楚，也正合“忠于一姓者小义也，忠于天下者大义也”的价值观。
作为中国历史上第一次大规模农民起义的领导者，陈胜死后的待遇也和后辈同行们大大不同。他没有被视为乱臣贼子，而是被刘邦正式追谥为“隐王”。“隐”这个谥号不算很好，有德行不明而空占君位的意思。陈胜并非完人，有坐视田臧杀害吴广、因小故杀旧友、信用奸臣、待人严苛、不听劝谏等污点，对于张楚的失败负有很大责任，所以“隐”这个谥号倒也并不算污蔑他。
不管是美谥还是恶谥，有这个谥号，就说明他是官方承认的合法君王。刘邦安排人为陈胜守冢，以礼祭祀，待遇同于六国诸侯。马王堆出土的帛书中，甚至使用张楚纪年，不用秦二世纪年。汉朝的官方尽管批评陈胜才薄德寡，但从未否认陈胜、吴广反秦有功。
陈胜、吴广的名字也成了历代统治者的梦魇，每当他们又产生老百姓好欺负的错觉时，就会有人提醒他们，就算强横如秦，戍卒一怒，也是三年而亡。最近的一次提醒发生在万历年间，礼部尚书郭正域在劝阻万历皇帝的横征暴敛时说：“自古乱亡之祸，不起于四夷，而起于小民。秦之强盛，兼并六国，卒之扰乱天下者，非六国也，乃陈胜、吴广一二小民也。”
事实证明他说对了一半，明朝的小民依旧很能打，驿卒奋臂，九州幅裂，但时代和秦朝不一样了，四夷也很能打。
就这样，孔鲋也配享大成殿，至圣孔子、复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思、亚圣孟子、后圣荀子、继圣子鱼，合称“儒家七圣”。
孔鲋配享还带来了一个变化，那就是所有年代比他晚的儒者都不能再在文庙供奉。新的文庙取消了十二哲、七十二贤的区别，所有先秦的儒家代表人物都一起在偏殿供奉。也就是说，董仲舒、周敦颐、张载、二程、朱熹、蔡沈、吕祖谦、陆九渊等人通通被以年龄不够为由清退了。闯军当然也允许祭祀他们，但是要祭祀就在家乡或者曾经任官的地方祭祀，不会在天下文庙里全都供奉了。
这一波动作着实大，连诸葛亮、李纲、文天祥、陆秀夫都被请出去了。但是这些人的待遇是不同的，将这些人请出文庙的同时，闯军也在襄阳、成都大修武侯祠，在李纲的祖籍地邵武、文天祥的家乡庐陵，以及崖山等地，都立庙纪念这些英雄。像董仲舒、朱熹这种闯军不待见的，旧有的祭祀不会废除，但也不许再立新庙。
经历过明末恐怖的大饥荒的闯军众人尤其厌恶董仲舒对“灾异说”的解释。皇帝犯了错，老天爷就降灾弄死老百姓来吓唬皇帝，皇帝要是不改，老天爷就降更多的灾，弄死更多的老百姓。真到了皇帝彻底失去天命，要换皇帝，还得老百姓自己动手。照这么说，合着老天爷只会弄死老百姓？怪不得皇帝叫天子呢，老天爷真他娘的是皇帝亲爹。
明末清初的艾衲居士的《豆棚闲话》中记载了一首歌谣：
“老天爷，你年纪大，耳又聋来眼又花。
你看不见人，听不见话。
杀人放火的享着荣华，吃素看经的活活饿杀。
老天爷，你不会做天，你塌了罢！
你不会做天，你塌了罢！”
这首歌闯军兄弟们也多曾唱过，对于他们中的很多人来说，从小到大就没见老天爷开过眼，越是勤劳善良，越是穷困、饿死，越是贪婪无耻，就越是富足。但随着闯军的不断胜利，大家的心态也开始转变了，觉得这世上还是有天道的，所以才会有“奉天倡义”的旗号。
李自成终究还是要做天子的，他支持的官方价值观总不能像谢逊一样说老天爷是混蛋。老天爷不能是混蛋，那就只能是董仲舒扯淡。所以闯军推崇司马迁，反对阴阳五行那一套，还推崇荀子的主张：“天行有常，不为尧存，不为桀亡。”
口水战当然是少不了的，不过这会儿的闯军还有“我流寇也”的优势，不用太在意舆论。闯军在尊孔尊儒这一点上咬得很死，所以也得到了不少儒生的支持。北边有张献忠、罗汝才、纳敏夫做屏障，闯军控制区和清统区不接壤，得罪一部分士绅也没什么。何况那些真正有能力叛乱的士绅也不见得在乎这个，只要闯军还是做出尊重名教、礼贤下士的态度，尊古儒还是尊宋儒都可以接受。
还有一件事震动更大，那就是闯军修了一部《后宋史》。