除了分配战功之外，还有一个重要的议题，那便是如何处置被俘的叛军和后金军。
“尚可喜所部背叛朝廷，投降建奴，全都该杀！”侯监军才问起俘虏该如何处置时，沈志祥便冷冷的说道：“便连跟随他们一同投降的辽民们也该杀！这有什么好商议的？”
金日观等诸将皆露不忍之色，郑冲却道：“沈游击，尚可喜麾下那些将士虽然曾今反叛，但临阵倒戈，捉了尚可喜来降，也算有功，不可滥杀，况且杀俘不祥。我以为当教细细查问，将数内叛逃时的首恶尽数诛除即可，其余被裹挟之人将功折罪，打散后编入各部如何？”
沈志祥冷笑道：“郑公子，一日不忠，百日不用，若这些人不想跟尚可喜一同叛逃，当时就该起兵反了尚可喜，而不是临阵之前，走投无路方才捉了主将来降。若是将他们编入军伍，谁人敢用他们？就不怕哪天阵仗上，一旦失利，他们绑了主帅去请降么？依我看，还是杀了干净。”
沈志祥这人虽然讨厌，但这话说得不错，尚可喜所部叛军那晚在海滩上，走投无路便捉了尚可喜投降，这种军队的士兵，哪个将军都不会喜欢，还真怕哪天把自己也卖了。
郑冲不由得陷入了沉思，金日观皱眉插口道：“若是都杀了，只怕有许多无辜之人，不若将他们编为辅兵，罚做苦力好了。”金日观这个提议得到了大多数人的赞同，沈志祥冷笑道：“若是今后再有人势孤而投靠建奴，麾下将士也不阻拦，只想着就算再回大明来，也能保住性命，那谁还肯死战？！”
此言一出，帐内顿时安静了下来，沈志祥说的没错，此刻东江镇孤悬海外，时常都是敌后作战，常有被围困的风险。若是这一趟这些反叛的士兵们能活下来，便会给人一种暗示，被迫投降能活命，就算将来再回大明也不会追究责任。一旦军队被围，将领意志不坚，定会率军投降，便再无人肯死战了。
郑冲微微诧异，这话会从沈志祥口中说出来，因为沈志祥这人在后世历史上可是投降了满清的。这家伙在沈世魁、金日观等人战死之后，收拢败兵退守石城岛，想要继续坐沈世魁总兵的位子，但明廷没有准许，于是这家伙便投降了建奴，随后跟随孔有德征讨南明，平定湖南，受封续顺公，这沈家续顺公居然传了十三世，一直混到光绪年间都还是王公世家，真是愧对战死皮岛的沈世魁！
一个后来投降满清的人居然会说出这样的话来，的确让郑冲有些诧异。
“不可，不能杀！”郑冲忽然朗声说道，诸将皆是目瞪口呆的望着郑冲，只听郑冲缓缓续道：“这些人肯捉了尚可喜来降，说明心中已有悔意，岂能滥杀？！更兼建奴那边还有许多被逼无奈归附的汉人，若是我们将回归之人杀了，岂不是寒了想要归明者之心？！”
说到这里，诸将皆是一阵讶然，只见郑冲站起身来，踱了两步后缓缓说道：“尚可喜所部，我们不但不能杀他们，还要奖叙他们的军功，并将此事广为宣扬！”
傅青主最先反应过来，抚掌笑道：“公子妙计，此举有千金买马骨之效。试想那建奴女真人口本来就少，死一个少一个，他掳掠我大明许多人口去，本就是想着以汉制汉。但若是我们能善待回归之人，必定让建奴那边身在曹营心在汉之人还能留下希望，待得时机成熟，便会回归大明，这样对建奴是极为不利的。”
郑冲颔首道：“不错，今后对于回归之人，只需仔细查问，诛除像尚可喜这样的首恶，从者不问，若是能捉得首恶回归者，还给予奖赏。那已经投降建奴的那些汉奸，只怕夜里都会睡不好了。”
侯隆也听明白了，笑着说道：“正是这话，建奴和孔、耿等汉奸若是知道这个消息，只怕今后领军出征都要小心，只怕一不留神便被属下捉了，临阵倒戈。哈哈哈，妙计，好计！”
诸将闻言也觉得此举可行，当下纷纷颔首赞同。的确，现下随着孔有德、耿仲明大举成建制领军归降建奴，开了一个极其恶劣的头，此前虽然建奴那边也有汉人，但许多都是被俘投降或是势孤而降。孔有德、耿仲明这两人却是率领水师并许多军民一起投降，意义绝对不一样，所以才有后来尚可喜跟风投降的。
要止住这种风气，以杀无赦来震慑，绝对只会起到反效果，这会让许多内心里不愿投降而只是被逼无奈投降的人，断了回归大明的念头。
争夺天下其实就是在争夺人心，这一点上不可否认，建奴皇太极胸襟宽广，做得的确是很好。最好的一个例子便是祖大寿的例子，崇祯四年，祖大寿在大凌河被围，不得已诈降后金，皇太极厚待祖大寿，并对祖大寿毫不怀疑，当祖大寿提议回锦州召集旧部来降时，皇太极毫不犹豫的答应了。
祖大寿回到锦州后便再次举兵抵抗后金，背弃了与皇太极的约定，皇太极也没有杀留在后金营中的祖大寿之子祖可法等人，反而依旧厚待，并不断写信劝降祖大寿。
而祖大寿对皇太极的招降置之不理，接着与后金军作战，一直到崇祯十五年，祖大寿被围锦州一年，军粮断绝，城内杀人为食，最后祖大寿见解围无望，才最终投降了后金。前后历时十一年，祖大寿做了一个大明臣子该做的一切，而皇太极也将千金买马骨这一招做到了极致，最后终于成功降服了祖大寿。
而后祖大寿其实并未替满清立下太多的功劳，但他起到的典范作用却让满清招降汉将汉臣更加容易，这就是皇太极费尽心力也要收降祖大寿的原因。
同样的若是明军能够一样的宽厚对待再次背反后金、回归大明的军民百姓，那么在争夺人心之上，也才能保持不落下风。要是杀了那晚投降的尚可喜所部将士，那今后谁还敢再投降你呢？
沈志祥见诸将都赞同郑冲的说法，也只是冷笑，不再多说什么。当下侯隆便按郑冲建议，定下一条规矩来，今后回归大明之人，不问前罪，只诛首恶，若是能捉得首恶回归者，当重重封赏。
接着侯隆又提笔将此事详细写成奏报，奏陈朝廷，建议朝廷对那晚捉得尚可喜投降的将士陈进喜、蒋武才等一百余名将士进行封赏，余人不论其罪。
而朝廷旨意未到之前，尚可喜所部投降的将士先打散分配各军中继续效力，同时还有救回的尚可喜部辽民，则编入皮岛辽民村落中，稍后郑冲会将他们安排到南浦港做工人。还有铁山大营中捉获的汉人辅兵们，也一同编入明军的民夫队伍中，继续为明军效力。
接着又说起其余俘虏来，尚可喜、许尔显、班志富等首恶自然是不能活命的了，但侯隆建议将这些首恶递解进京，交朝廷处置。
郑冲知道侯隆的意思，这些叛将递解进京后，只有一个下场，那就是菜市口凌迟处死，传首九边，以儆效尤。这回郑冲没有什么异议，像尚可喜等人这种首恶，自然该有此报。
同时还有被生擒的许多建奴俘虏，侯隆也建议递解进京，献俘京城，也好涨一涨民心士气。
侯隆的想法很好，但他忘了一件事，如今皮岛上除了龙须号外，能用的战船不多，后金俘虏不少，这样一算来，难以将这许多俘虏都运回京城去啊。
当下郑冲便建议还是先奏报朝廷，若是朝廷有意要将俘虏运送进京，那就让登莱水师派船过来运送，毕竟龙须号此刻不能离开皮岛。
商议完军功与俘虏之事后，又说起战利品分配来。原本沈世魁已经派兵守住了铁山大营内的粮仓府库，就是打算独吞这些粮草器械铠甲，但现下沈世魁身故，侯隆以监军之职暂摄主帅之位，那这些战利品分配自然是要重新分配。
军粮自不必说，岛上缺粮，铁山大营缴获的粮草虽然极多，但积谷防饥，这些粮草是不能随便分配的。当下侯隆便按郑冲建议，将军粮统一集中管理，各军按需求发粮，控制住粮草，也不怕各部会有什么异动。
其余铠甲、器械自然是补充给各部军马，这个倒也不必节省，接下来还有大战，军中武备充足，战力也能提升。说起建奴铠甲来，样式其实多是相仿明军，就算服色不对，也可将铠甲穿在其中，外面用明军战袍包裹便是了。至于缴获的建奴旗帜、印信等伪物自然是要连同奏捷文书一同先送入京城去报功的。
奏捷文书、报捷的物事、连同叶臣等人首级都准备好后，郑冲便请皮岛水军中安排了三艘百料的福船负责运送，数内少了阿山首级，只因阿山堕入海中，未能找到尸首，只得以阿山的将旗印信为凭奏报战功。
郑冲派了俞硕明前去进京报捷，侯隆这里也差派了跟随他的两名小太监一同回京，皮岛上则是金日观、陈平朝和沈志祥三人各派了自己心腹将领各一人，一同跟随进京报捷。