烂尾大纲遁：
摩天楼：毛利叔设下了陷阱, 想要借riphath的手除去gin和vodka。
事情和电影里发展的很相似，女社长死亡后, 双子楼引发了爆炸。在毛利叔的要求下，少年侦探团和小兰园子乘坐同一电梯离开。
发型与灰原相近的园子招来了杀身之祸, 虽然在柯南的提醒下避过了子弹，但电梯仍然坏了。
灰原通过微型对讲机将射击方位报告给了riphath，同时和毛利兰等人展开自救。
riphath在得知了方位后摁下按钮炸毁了另一栋双子楼gin所在楼层。
原来给如月峰水提供炸药的正是riphath，是毛利叔暗地里从中牵线布的局。
vodka见到爆炸意识到他们被人算计了，这是个圈套。但因为gin生死不明一时间慌了手脚，他反复犹豫终于决定冲向爆炸楼层去和gin取得联系。
火势很大，vodka没能找到gin, 很快他放弃了寻找准备逃生时被尾随而来的帕帕制伏。
帕帕想要套出那个程序的消息, 却没想到还没死的gin拿着枪从废墟里走了出来。
两方对峙之时，帕帕发现他所得到的消息似乎与gin掌握的有些差距。他开始怀疑幕后有人动手脚。
gin放弃了vodka的命一心想杀了帕帕，帕帕则以付出了一条手的代价逃脱而出。
因为楼下聚集着大量的警察，gin无奈放弃了追踪独自一人离开。
事后帕帕和riphath联系灰原哀询问这件事的来龙去脉, 只是所有的线索都似乎没有头绪, 于是暂时作罢。
起疑：
gin逃离后着手调查帕帕的身份，他找专家做的面目五官拼图无意中被远东区的boss和被派遣来日本的bourbon看到。
boss并没有在意，反而是bourbon开始好奇这个人，他也让手下撒网追查此人。
事务所这边暂时平静。毛利叔犹豫是不是该推动gin和riphath的仇怨更深一步，让他们不死不休。
但小兰却带来了一个坏消息。
她们班转来了两个外国交换生兄妹，一个叫拉菲?格兰利，一个叫菲特?格兰利。
毛利叔发现了这两个大胆的以酒为名的人, 立刻警觉。他不知道这是巧合还是真的抱有目的前来。
贝克街：
工藤优作又一次来到日本，虽然借着游戏的名义，但毛利叔认为危险已经迫近。
游戏发布会那天，工藤优作和毛利叔来了一场私人对话，他试探毛利叔是不是claudean，并提出年龄从一开始就是伪装的猜想。
毛利叔否认了他荒谬的推论，并表示，工藤优作在做一件愚蠢的事。
工藤优作说他查到黑羽盗一曾经和威灵顿公爵有私交，而那正是claudean名义上的祖父。
毛利叔问工藤优作是否调查过他的身世。工藤优作没有否认。
毛利叔追问工藤优作是从哪里知道有个叫claudean的人，工藤优作说曾经见过一个长相很相似的外国人，是他在icpo的朋友。
毛利叔意识到不妙，很可能对方是故意纵使工藤优作去调查他，借机来圈定目标。同时他也对那个所谓长相相似的人好奇。
只是以他现在的实力无法进一步窥探此事。他也明白，如果真的是暴露了，就是死无葬身之地了。
毛利叔决定找人帮忙。
满月篇：
贝尔摩德想要揪出灰原哀，布下了万圣节陷阱。江户川柯南收到信件后想请服部来帮忙。而许久没出现的黑羽快斗突然间联系他希望参与这件事。
他告诉江户川柯南贝尔摩德是他父亲曾经的弟子。他有些事情想要去求证。
江户川柯南拒绝了坦言无论黑羽快斗从什么地方知道这件事他的计划里都没有让他和贝尔摩德面对面的机会。
黑羽快斗没有坚持，但他告诫江户川柯南不能大意。
当晚，一切如计划进行，贝尔摩德的身份被揭穿，她和茱蒂缠斗时被江户川柯南打落了□□，同时，茱蒂趁着贝尔摩德不注意，移动到死角制伏了她。
直接身体接触的贝尔摩德立刻识破了茱蒂的破绽，原来她是黑羽快斗假扮的。
后者在江户川柯南震惊的眼神里扯下伪装。
黑羽快斗问贝尔摩德当年他父亲的死因到底是什么，是不是和欧洲那边有关。贝尔摩德对黑羽快斗竟然知道这点有些惊讶，然后表示具体的不清楚，但的确有欧洲介入。
此时灰原哀前来，贝尔摩德趁着众人分神逃脱而出。
黑羽快斗因为赤井秀一的出现也只能匆匆离去。
但贝尔摩德没能逃远，她被riphath和帕帕捕捉了。
迷宫篇：
毛利一家来到京都，他们碰到了服部平次等人和小兰的同学拉菲、菲特。
拉菲和菲特加入了毛利叔的队伍。柯南在寺庙参观的过程中发现了gin的身影。
他立刻就秘密追踪gin。gin也没觉察不妥，被他顺着发现了一个京都根据地。
柯南和服部商议前去查探一番。正要出发前却被毛利叔制止。
但柯南仍然想方设法偷偷溜去了。
毛利叔不确定这是否是圈套，所以在发觉时并未前去。反而是暗中和别人通了电话去调查。
柯南和服部扑了个空，那里并没有什么交易地点。毛利叔看到拉菲和菲特一直不曾离开，确定这极可能就是个陷阱，于是决定反客为主。
只是他在下命令前见到了和柯南服部一道回来的黑羽快斗。
毛利叔把计划暂时作罢。
当晚黑羽快斗找到他想要谈谈。
黑羽快斗说他找到了他父亲曾经的日记本，并在那里了解了父亲当年在全球四处偷窃的经历、原因。
他问毛利叔为什么他父亲为他找□□的时候，他却娶了妃英理。
毛利叔什么也没回答，只是问日记本在哪里。
黑羽快斗再一次问他父亲的下落。
毛利叔说，盗一死了。
博弈篇：
服部平次和柯南不甘心放过gin，他们延长了留在京都的时间。柯南同时还联络了在东京的工藤优作。
工藤优作表示他从icpo那里得到了消息，的确组织在京都有据点。
灰原哀本不赞同他们的行动，但她接到riphath和帕帕的消息，从贝尔摩德口中证实了这一点。
工藤优作寻求fbi参与这个活动。
他们成功的找到了组织的京都联络地，并将其一举摧毁。
事情传到远东区高层，bokma震怒，他在出差回来的bourbon建议下找到fbi在日的小组根据地报复。
茱蒂当场死亡，詹姆斯也重伤，只有赤井秀一勉强逃脱。
fbi高层获悉了这样的惨讯，同时他们得到匿名线报说找到了东京根据地。
原来之前组织的行动虽然造成了惨重的伤亡，但正面的交锋留下了线索，也与线报吻合。
fbi当机立断，他们派遣特殊行动小组潜入东京，由赤井秀一带队完成剿灭。同时联合icpo向日本政府施压，要求对政界和商界的可疑人士排查。
他们的行动出乎意料的顺利，像是东京内部出了叛徒一样，轻而易举就给予了沉重打击。
然而就在他们想要彻底将这个势力摧毁的时候，组织却像人间蒸发一样，所有的痕迹都被抹去。
间谍篇：
众人对组织为何突然间隐去踪迹好奇不已。毛利叔则敏感的意识到之前拉菲和菲特来日本的目的很可能根本不是他，而是另有图谋。
他从暗处得知当日京都引发一系列行动的所谓gin是另一个叫bourbon的人假扮的。就在毛利叔想要让人进步一去调查这个bourbon是何许人也，灰原哀那边却出事了。
毛利叔本要去阿笠宅接柯南回家，走到半路的时候陪柯南会去取一件东西，却看到灰原哀被人带上一辆黑色的轿车。柯南想要冲过去救她，被毛利叔一掌击晕偷偷逃离，而在回事务所的路上，毛利叔被riphath的一通电话拦下。
三者见了面，riphath试探毛利叔的身份无果。同时柯南醒过来后向riphath询问灰原哀的被抓到底是为什么。席间他向毛利叔坦呈了自己工藤新一的身份和黑衣组织有关的事。
毛利叔掩饰过去后，柯南被riphath告知灰原哀是他们故意置之不理让组织抓走的。
同时riphath告诉柯南，抓灰原哀的并不是他知道的那个黑衣组织。
riphath离开后，柯南与毛利叔定下约定，包括以后向小兰解释清楚道歉等一系列的事，毛利叔也透露以前当刑警的时候有点印象，需要去警局考证。
柯南与他分开和黑羽快斗碰面。黑羽快斗警告柯南不要再插手这件事，否则会有性命之忧。
柯南问他是否与之前riphath提到的“不是黑衣组织”有关，黑羽快斗透露了一部分组织结构给他。
毛利叔找到长谷川空询问拉菲和菲特，后者告诉他他的猜测没错，拉菲和菲特的确是借由fbi的手伺机吞并远东区的势力，现在几乎已经成功瓜分了这里的组织。而灰原哀之所以被那么要紧的抓走，也是因为拉菲和菲特知晓aptx4869的重要性。
长谷川空还告诉他，bourbon是菲特派来远东的。这一系列的事正是由他从中牵线。
毛利叔表示尽管拉菲和菲特得到了他们的分成，但fbi对组织的打击不小。
长谷川空认同他的看法，也认为这件事很可能有fbi的间谍参与。
bourbon的嫌疑不小。
试探篇：
毛利叔决定借由fbi来铲除组织，并试探暗中到底还有谁在调查他。
他让柯南发现gin的行踪，伪装成线人暗示fbi后面有大鱼。fbi没有上钩，仅仅只让赤井带着少数人马前去。反而是icpo很轻易的就出动了大队人马。
行动小组的确发现了目标，但受到狙击，icpo伤亡严重。
毛利叔肯定fbi在组织有间谍，而icpo伤亡惨重也似乎不在预估范围。
此时，毛利叔终于查到那个与他长相相似的人身份便是如今组织最高领导人的副手，代号罗曼尼康帝。也证实了拉菲和菲特就是东欧和北美的组织统领代号。消息来源是威灵顿公爵。
但威灵顿公爵虽然证实了这些人的身份，却不能告诉他这几个人之间有什么利益纠葛。
向长谷川空询问同样无果后，毛利叔只能打出第二章底牌，他联系了意大利教皇。
后者暗示他，罗曼尼康帝和拉菲关系不合。
老者问毛利叔既然已经联系他了，是不是意味着准备重掌原先的势力，意大利这边还有人一直等着他回来。
毛利叔说他正是因为不想回去所以才只联系了教皇。他相信教皇不会暴露他。
老者告诫他恐怕很难如愿。
毛利叔希望教皇在他一旦暴露后提供后路。也再一次强调自己不愿意回到这些事情里的决心。
教皇答应。
在毛利叔整合完毕这些消息制定对策前，帕帕和riphath找上门来，确定的宣称他们已经猜到毛利叔的身份了。
毛利叔想到之前教皇的承诺不再否认。三人叙旧，riphath认为黑羽快斗是毛利叔最大的破绽。毛利叔则表示即便没有黑羽快斗，工藤优作的调查也几乎让他无处可藏。
riphath嘲笑他分明是在为黑羽快斗开脱，对毛利叔当年的行为愤怒，但得到毛利叔的道歉后却发觉毫无意义。
riphath认为毛利叔已经变了。
三人的叙旧因此沉默，紧接着围绕组织的事讨论。
在接收了riphath的信息后，毛利叔初步揣测了整件事情的缘由。
菲特和拉菲利用bourbon为诱饵诱使fbi来铲除远东势力。在消灭了大部分远东统领的亲信势力后，趁机接管并隐藏。
fbi与icpo的共同行动所找到的组织成员是拉菲和菲特的手下，而非以gin为首的原远东势力。fbi没有出动人马应该是在组织内部有更高级别的线报，而icpo的贸然出击则是化名为罗曼的人一手推动，一方面减弱icpo的战斗力，一方面向拉菲施加压力作为警告。
帕帕认为既然组织在内斗，完全可以推波助澜。riphath则谨慎的认为fbi在组织内部的间谍级别既然那么高不如坐山观虎斗。
毛利叔询问了这些年组织高层的动作，虽然帕帕和riphath在毛利叔当年离开后也走了，但对组织的那个领导者还略有了解。
毛利叔曾经的弟子denis在九年前上台后继承了dionysus的名字，而那个罗曼是在大约七年前组织大动乱不久后上位的，由dionysus一手扶持。
这次罗曼利用工藤优作，无论是否是他本人的意志，背后的dionysus迟早会知道。而毛利叔的身份也肯定瞒不了多久了。
甚至，极可能组织的内斗都是一手策划来专门蒙蔽毛利叔的。dionysus对找到毛利叔会不择手段。
毛利叔却说，即便是陷阱，他也要参与这场内斗。riphath劝说无果，三人商量具体的实施方案。
内斗篇：
毛利叔借由威灵顿公爵的势力大面积针对菲特的领域实施骚扰和打击。引起组织的警惕后又停止了所有行为，转而由riphath等人联系美国方面。遣动cia对拉菲所属的北美实施骚扰和打击。数个大型交易泡汤后，拉菲也终于停止了在日本地区的行动，专心处理北美事物。
但她刚刚将事态有所掌控时，原本未参与cia行动的fbi突然间也加入了逮捕行动。
北美的事态时空，数十位高层政商被闪电逮捕。拉菲想赶回北美遏制这一切，菲特却伺机抢占远东的地盘。
拉菲不愿放弃这块到手的肥肉，派人暗中在欧洲做小动作，并伪造成之前毛利叔实施的骚扰。
菲特不动声色警告拉菲停止，并劝说拉菲放弃远东的大部分所属权，否则再迟一些赶回北美，恐怕会有新的变故。
拉菲表面答应却不甘心那么久布置的心血全都泡汤，正在此时，原本残存的bokma手下派出gin为代表找拉菲谈判，希望能够结为同盟对付菲特。
拉菲嘲笑bokma的不自量力，gin则嗤笑拉菲别忘了还有个罗曼在背后虎视眈眈。
拉菲与bokma达成初步协议，bokma帮她牵制菲特，bokma得到拉菲的实质支援。
但在拉菲赶回美国之前，fbi和cia又停止了动作。菲特趁着拉菲放手远东时，直接快速袭击了bokma。拉菲察觉为时已晚，她勃然大怒。菲特只是认命bourbon去给拉菲工作，没有任何收手打算。
抢占了先机的菲特开始抢占北美份额。拉菲不得不忍痛让出在墨西哥的利益，要求和菲特谈判。
原来bourbon是拉菲安插在菲特身边的间谍，bokma找拉菲谈判的消息暴露了bokma本身，菲特正是因此才重创bokma。
菲特希望拉菲彻底放权远东，这样他才会停止在北美的动作。拉菲被菲特的要求彻底激怒，虽然口头答应，私底下却动用了安插在欧洲的力量反咬菲特。英国的特工和美国fbi也同时出手。
riphath等人分析了组织的内斗迹象认为虽然一开始是由他们掌握时机，但后来fbi介入的太过天衣无缝。
短短的一个月不到的时间，这个藏在组织内部的间谍就已经造成拉菲和菲特两个势力的重大伤亡。手段实在高明。这个人还非常的了解双方。
毛利叔和riphath还在好奇为什么到现在那个“罗曼”还不出手，警视厅就传来消息。有大规模组织犯罪。
决斗篇：
bokma不再隐藏，高调犯罪，日本警方介入调查。fbi因原行动的机密性不得不暂时撤退，而icpo则忽然间声称需要和高层汇报，重整人员再作打算。
只是死地而后生的bokma令菲特想要完全掌控远东的计划被打乱。
gin的手下由东大的老教授之手向riphath交了一份信，称灰原哀已经在他手中了。另一方面毛利兰和铃木园子外出时也被绑架。柯南同样收到了来自gin的信。
柯南，工藤优作，服部平次，毛利叔，妃英理聚在一起商量。因为gin没有提出任何要求也没有任何恐吓的话，众人一时间无从下手。
此时，黑羽快斗带来了vermouth的消息。
原来当初riphath捕捉了vermouth和她做了一笔交易。
vermouth知道aptx4869，也知道自己的特殊，而riphath说他会让灰原哀成为替代vermouth特殊性的人，抹杀vermouth的地位。riphath希望vermouth和她合作，毁掉组织也好，脱离组织也好。都可以。
vermouth明白其中的利害关系，答应合作，返回了组织，也为让灰原哀的返回埋下伏笔。
vermouth告诉众人，拉菲和bokma曾达成过交易，其中灰原哀就是交易的一项内容。所以现在灰原哀在bokma手里。
工藤优作等人对日本竟然还存在另一股组织力量的事实大为震惊。他认为毁灭组织单靠日本警方是不可能办到的。
黑羽快斗质疑icpo的可信度。毛利叔却称这可以一试。
riphath和帕帕得知后，困惑毛利叔为什么明知道icpo里有罗曼泄露消息也要冒着危险合作。
毛利叔没有解释，而是拜托帕帕和本家联系，必要时采取帮助。他也希望riphath和帕帕本人不要介入行动了。
众人焦急的等待组织的消息，而终于对方寄来了一段录像带。作为释放灰原哀和毛利兰等人的条件，需要所有警方的调查行动停止，icpo和fbi撤离日本。作为补充条件，他会向fbi提供一些他们想要的东西，前提是当面面谈。
他们希望工藤优作作为icpo的代表人，而fbi则由赤井秀一出面。而妃英理、毛利小五郎、江户川柯南作为毛利兰和灰原哀的亲友也必须在场。他们还可以再带一个人，这个人是谁由他们自己决定。
消息转告fbi和icpo，icpo认为工藤优作不具备代表他们谈判的资格，驳回了这个无理的条件，fbi也以真假无法鉴别为由不愿答应。
工藤优作亲自去和罗曼商量，拜托他能帮忙。罗曼称自己已经尽力，还会继续想办法。工藤优作心急如焚。
罗曼拿出一份文件交给工藤优作，称这是icpo对组织那个aptx4869药物的调查。
有关潘多拉的宝石传说，aptx4869永葆青春返老还童――等等。
最重要的，里面称这是有着起死回生之效的药物。
而组织似乎曾经做过实验。在九年前用这个药救回了一个人。
毛利叔保持镇定，回去后就要求riphath和帕帕等人向fbi和icpo施压，要求彻查资料。
riphath冲毛利叔怒吼，认为他疯了，这种虚构的资料竟然也会信以为真。
但毛利叔一意孤行。
riphath最终没能制止毛利叔，fbi和icpo很快更改了决定。
赤井秀一提拔为日本负责人，而罗曼想亲自参与谈判，工藤优作则作为那个多余的名额一同前去。
地点最终定在京都某地，bokma派出以gin和vermouth为代表的手下确认众人并无跟踪便带进一处隐秘的地下处所。
bokma开门见山，他愿意提供拉菲和菲特的资料，他希望和警察合作，借由fbi和icpo的手铲除拉菲和菲特在日本的势力。
他强调，如果没有他做引线人，那么以现在fbi和icpo的能力是不可能对菲特和拉菲构成威胁的，单看之前的消隐无踪就能窥见一二。
罗曼认为这样的条件太虚，如果组织内斗真如bokma所说，他们大可以坐收渔翁之利。更何况与犯罪组织联手是不可能的。
bokma称这场交易是双方共赢，即便它是犯罪组织应该被法律制裁，那也得警方有那个能力。现在最好的决定就是联手，fbi帮他摧毁菲特和拉菲的势力，他放回人质。到那时倒戈相向也无妨。而现在，主动权在他们手里，警方比他想象的还要在意这几个人质。
赤井秀一和罗曼工藤优作等人商量后同意的这个交易。bokma愿意交出铃木园子和菲特拉菲的资料，fbi需要暂时牵制对方，然后bokma才会交出剩下的毛利兰和灰原哀。
毛利叔提出需要和毛利兰亲自见面确认安全才行。
bokma犹豫片刻应允。
很快毛利兰和铃木园子被带到了谈判现场。铃木园子被放行，毛利兰则被gin亲自看管。
赤井秀一上前和bokma完成交易。
就在此刻异变突生。
一直跟在bokma身边的一名手下用枪抵住了bokma的太阳穴，并夺走了他手中有关拉菲和菲特的资料。
同一刻。保护该秘密基地谈判的防卫系统被迅速瓦解，只是转瞬，拉菲和菲特就已经带着手下慢悠悠的走进室内。
拉菲笑称多谢bokma，若非他卖力，今天也没那么容易的捕捉这些瓮中之鳖，更不会那么容易的趁着大家的注意都在找这里轻易的毁了那些监视的暗桩和某些零散的警察力量。
最重要的，这出由罗曼一手推动的局她怎么也得领情。
毛利兰和柯南等人还在震惊拉菲和菲特的身份，工藤优作就反应过来拉菲口中的罗曼身上的疑点。
工藤优作惊疑不定，罗曼则很镇定的应对身份暴露。他向工藤优作道歉。
工藤优作表示自己虽早有怀疑，但没想到罗曼的身份如此之高。
罗曼和工藤优作没有更多交流，转而和拉菲交谈。
原来拉菲虽然和菲特在北美和欧洲斗得死去活来，但从没有永远的敌人，他们意识到本来愚蠢不值得在意的bokma身后有罗曼的身影后就立刻重新结为同盟。
此刻罗曼伪装成icpo的人前来，已经断了和别人的联系，他们现在完全可以轻易的杀了罗曼而不必担心什么后顾之忧。就算杀不了，也能借机洗牌三方的势力。
罗曼深处险境仍然镇定，他称赞了拉菲和菲特在这时仍然能够找到最合适的结盟的方法，又对拉菲这段时间以来一系列在远东干的事大加赞赏。
最后他笑问拉菲在大肆内斗的时候是否忘了来远东的源头契机。
拉菲和菲特脸色立变。他们想起之前来远东顶着的名头就是插手黑羽盗一和黑羽快斗的事。只是他们都默契的以此为遮掩。上层也一直默认他们在远东内斗的事实，并未如何强调黑羽快斗，甚至等到罗曼介入他们都下意识的认为那是来参一脚搅乱他们平衡从中获利的。
事实上罗曼的行为也验证了他们的猜想……
但现在罗曼却抛出了这个最早的借口。拉菲和菲特都警惕的盯着罗曼。
罗曼掏出手机，虽然旁边都有狙击手，但拉菲没有制止他。很快拉菲和菲特都收到短讯。
他们面色铁青的让手下解除了武装。不久一个青年走了进来。
罗曼很自然的无视身边的狙击手迎了上去，拉菲和菲特向来者行礼。
那正是组织的领导者dionysus。
bokma还没开口，dionysus就示意拉菲这样的废物不需要存在。bokma死亡。
dionysus仔细打量了工藤优作和柯南，感慨他们长得的确很像。
紧接着他站到毛利叔面前，称呼他为老师。
众人大惊，工藤优作即便有过心理准备也没想到这一层。毛利叔没有回应，而是在沉默很久以后细数之前发生的所有事。
无论是罗曼故意泄露资料让工藤优作查他，还是让黑羽快斗意识到他父亲的死因蹊跷，甚至拉菲和菲特的争斗，fbi和icpo的改变都是诱饵，让他露出马脚。
dionysus全都承认。
毛利叔嗤笑他十年了竟然还和愚蠢的小孩一样用这种损害自身的方法。
dionysus则表示若非毛利叔的伪装太出色，他也断然不会布这样的局。
他感谢工藤优作让他知道被瞒了几十年的秘密――毛利叔的年龄。
dionysus感叹毛利叔的易容技艺神乎其神，竟然骗了他那么久，就连黑羽盗一死的时候他都没发现。
紧接着dionysus又变脸，嘲笑毛利叔竟然真的相信了罗曼那种完全没有可信度的谎言。
他摸着毛利叔的脸眼神憎恨，诅咒了毛利叔对黑羽盗一的感情又让手下带来的被绑住的黑羽快斗。
dionysus说一个毛利兰还不够让毛利叔在意，那么再加一个黑羽盗一的儿子。
被绑的毛利兰惊慌失措，她问毛利叔这到底是怎么回事。
妃英理厉声让毛利兰安静，然后镇定的问毛利叔是不是易容的。
毛利叔问妃英理已经猜到了。妃英理说是。
毛利叔沉默然后郑重的向妃英理道歉，接着他除去了脸上的易容。
众人都被毛利叔的真实容貌震惊了，最无法接受的毛利兰接近崩溃。
妃英理最终克制住自己，没有继续问其他东西，而是轻声对毛利叔说他欠她一个解释。
毛利叔点点头，把众人的反应全都无视，而是问dionysus找这么一个与他如此相似的人的动机。
dionysus说这和你找工藤优作和黑羽快斗的原因是一致的，只不过毛利叔更可悲也更胆小。
黑羽快斗插话问毛利叔他的父亲到底怎么了。
dionysus将九年前发生的事道出。
原来在毛利叔伪装身份失踪之后，denis就非常不甘心，一心想要找到毛利叔，他也一度非常想向黑羽盗一下手，只是当时的dionysus制止了他的行动，直到十年前dionysus去世，denis继承了领导者的位置成为的dionysus，这才掌握大权。
在稳定了内部之后，dionysus立刻派出杀手去暗杀黑羽盗一。
而他最终也成功的杀死了黑羽盗一，就在毛利叔眼前。
毛利叔问黑羽快斗，他是不是已经看完了盗一的日记。黑羽快斗说是的，但他不知道盗一到底是为什么死的。
毛利叔就将盗一死前的事向黑羽快斗和盘托出。
当时的毛利叔一直在暗处注视着黑羽盗一，而盗一最终察觉了。通过试探，盗一就确定了毛利叔的身份。两人见面并确认了互相的心意。盗一决定和毛利一起离开。为此，他伪造了自己的魔术失败。毛利叔也将小兰送往妃英理家中，并在家中留下信，说明一切。
他们约好第二天相见。毛利叔卸下伪装在约定的樱花树下等盗一出现，然而就在黑羽盗一抵达之时，埋伏在远处的狙击手杀死了黑羽盗一。
那正是dionysus派来的杀手。
黑羽快斗这才明白为什么自己父亲还会事先安排好17岁就能打开的魔术。因为父亲的事故是他自己安排的。
毛利叔说盗一的死都是他的错，他很抱歉。黑羽快斗问毛利叔之所以一直对他好、容忍他是不是也全都源自他的父亲。
毛利叔说是的。
dionysus说毛利叔还是一如既往的绝情，只不过这一次他才是赢家。
他要毛利叔交出手中的势力，乖乖跟他回去，到与世隔绝的地方一辈子不再出来。
毛利叔说他这种想法太可笑，而且他现在就以为自己已经赢了太天真了。
dionysus问毛利叔难道他还有办法从这重重包围圈里逃出去的办法。
毛利叔说这不是包围圈，不过是半个圆。
反转篇：
dionysus神情困惑，拉菲在毛利叔的眼神扫到她附近之时，脸色立变。但她没能反应过来就已经被菲特劫持。
谈判室的自动门快速封闭。
菲特的手下马上调转了枪头与拉菲手下对峙，原先劫持着毛利兰的人放开毛利兰转而掏出枪抛给赤井。
dionysus对菲特的转变吃惊不已，只有拉菲恶狠狠的说果然如此。
菲特问毛利叔他是怎么发现的。
毛利叔说他一直察觉到组织的上层有fbi的高级间谍，而且还是直接受命最高层的。之前侵入资料库的时候就有看到消息传递。
原来菲特是fbi打入组织内部的最高级别间谍，从小就潜入组织，一直往上攀爬做到了如今的位置。
他故意挑起拉菲对远东的兴趣，一手促成三方势力的互斗，内耗组织的实力。一边架空欧洲的同时，一边通过和拉菲的内斗消灭北美和欧洲的高层势力。
这些年更是收集了许多资料就借着这次机会要重创组织。
因为他知道，罗曼的背后一直站着dionysus，而dionysus最大的目标是毛利叔。
就像dionysus用他们的动作掩饰自己查毛利叔的目的，他也利用dionysus查毛利叔的目的掩饰自己真实的计划。
他也猜到拉菲对他有所怀疑，所以任由bourbon监视他，同时让拉菲误认为bourbon才是真正的间谍。
这次行动他看到罗曼亲自前来就已经猜到，因而任由拉菲派bourbon和她手下的人去做袭击fbi和其他警察的任务，而排出自己大部分的手下作为包围这里的人手。
其中陪他走入这个房间的人已经由fbi的特工秘密替代了。
菲特隐藏了近二十年，自小在组织长大，因此他的叛变是连dionysus都没有猜到的。
菲特说只要这堵门降下，那么外面他的手下很快都会把拉菲和罗曼带来的人清除。虽然那些人都不是fbi的，但是他们全都听命与他，他之前和拉菲敌对的关系让那些人觉得杀死拉菲的手下情理之中。
而这个密闭的环境中，拥有绝对人数优势的是他们。
菲特感谢毛利叔为他创造的绝好条件。罗曼意识到毛利叔会来，根本就是猜到菲特的身份而来作一个赌博。
甚至于，之前插手菲特和拉菲露出马脚的行为都极可能是诱人入瓮的陷阱。
dionysus怒极反笑，他用枪指着黑羽快斗说在他手里还有这个人质的时候毛利叔就不敢轻举妄动，而这段时间足够他的手下把菲特这个叛徒的势力清理了。
毛利叔摇摇头说恐怕dionysus要失望了。他的手下非但来不了，还很可能被别人清理了。
他在扯下易容的时候就已经向别人发送的信号，那么长时间足够他们动手了。
dionysus说fbi的人还没这个能力，毛利叔说这可不是fbi，而是他在意大利的朋友帮得一次小忙。
dionysus说教皇的势力在黑羽快斗17岁以后已经撤离了，问毛利叔从哪儿来的意大利的朋友帮忙。
毛利叔说dionysus果然还是太失败了，他父亲很早就察觉的事他竟然到了现在还被蒙在骨子里，看来组织注定要毁在他手中。
罗曼接到电话，意大利黑手党联合日本当地势力插手干预了，还有来自德国的大财阀突然狙击组织名下的几家大公司。
毛利叔笑着告诉dionysus，即便他找了他那么多年，到头来还是一败涂地。
dionysus有些歇斯底里的问毛利叔为什么一直骗他，从第一次见面起，从名字到身份，从长相到年龄全都在骗他。当年又为什么一声不吭的假死丢下他离开。
毛利叔说正是因为dionysus的不冷静才导致如今这样的局面。他应该在一开始就认清自己和他的师徒关系不过是逢场作戏，不过是一场交易，一个筹码。
dionysus的父亲在毛利叔成为高层不久就猜到毛利叔的身份不简单，但他没有对毛利叔动手，反而赋予毛利叔更大的权力，同时把dionysus交给他。
两人曾有过一场私人对话，他希望毛利叔能够在普通情况下顾念和他儿子的情谊。又或者当两者对立之时，毛利叔能成为他儿子的试炼，验证dionysus是否有资格成为合格的组织领导。
他希望毛利叔留dionysus一条命。至于组织的存在，如果dionysus真的成不了事，那么组织毁在他手里也理所当然。
毛利叔告诉dionysus，九年前他没有出手毁了组织，九年后他也不会出手。但并不是他没有这个能力，就像他当初很简单就毁了远东的根基，现在毁了组织也不是难事。
他问dionysus，是要他真的动手，还是放弃对他的念头放了黑羽快斗？
dionysus不愿意，而罗曼在毛利叔的眼神扫向他的时候突然出手击晕了dionysus，他用黑羽快斗和毛利叔达成暂时协议。黑手党退出争锋，毛利叔停止对组织的行动。他们要安全离开这里。
至于以后黑手党是否还要分一瓢羹，fbi又有什么行动那要看他们应对的本领，和毛利叔无关。罗曼承诺不再找毛利叔。
毛利叔从他的语气中听到了取而代之的意图，两人心照不宣的一笑。接着罗曼接到黑手党撤离的消息，放了黑羽快斗，趁fbi未反应过来，抱着dionysus从事先以防万一的暗道逃离。
余下的菲特仍然劫持着拉菲，因此拉菲的手下不敢轻举妄动，众人松了口气，开始琢磨如何从这里安全离开。
对罗曼的逃离，菲特并没有异议，但他也知道一旦放虎归山，接下来他们想离开这里就不容易了。
果然他收到心腹的消息，罗曼安插的人在破坏他对整个基地的控制力。好在现在事态未失控。
菲特劫持拉菲，让她命令几个手下束手就擒。拉菲照做。
一行人通过接受监控中心反馈的消息快速撤离。
妃英理毛利兰等人由赤井秀一带着率先离开，毛利叔和菲特及一干人员断后。
拉菲走着走着突然和菲特分析罗曼这次回去以后会作的动作，她还说就算她能活着走出这里，也失去了在北美的权力。
菲特说只要拉菲愿意，他能帮她申请证人保护计划。拉菲却不屑。
正在此时，监控室与菲特的联系中断了。菲特的手下一失神，之前非常安静的gin忽然出手夺过压制他的□□。连续射伤了两名fbi特工，枪声引来了守备人员的注意。场面非常混乱，赤井秀一等人被组织的人发现，他们虽然是菲特的手下但不是fbi的人，因此立刻掏枪追杀赤井等人。
毛利叔不得不前去帮忙，这其中柯南虽被毛利叔救了一次却仍然在保护小兰时胸部中弹，性命垂危。
菲特一分神，拉菲就借机逃脱，菲特只得率领手下追踪拉菲，双方混战。
拉菲废了菲特的一只手，但在最后关头没下杀手，最终被菲特击毙。菲特抱着拉菲的尸体等来了fbi的支援。
gin和之前切断通讯造成混乱的基蒂安等人汇合，本想趁乱逃走但与救出灰原哀的贝尔摩德碰面。双方缠斗的时间令gin丧失了最好的逃脱机会。
gin被赶过来的fbi击毙。fbi问vermouth是否和他们一起出去。vermouth拒绝了，她让fbi带走灰原哀，自己独自一人离开。从此不再出现。
柯南被送往医院做手术，小兰因为精神打击过大也被要求住院观察。
fbi清扫了在日本残余的组织势力，尽管没能找到罗曼，但成果斐然，几乎连根拔除了组织。
一切都恢复平静，帕帕和riphath告诉毛利叔菲特死了，死在fbi的手里。和拉菲被葬在一起。
两人把aptx4869的解药交给毛利叔。毛利叔感谢帕帕出手狙击组织的公司。帕帕则问他怎么处理接下来的事。
但两人都没等毛利叔回答就离开了。
毛利叔找到妃英理，他向她解释了一切。包括自己杀了曾经的毛利小五郎，故意和她分居掩饰自己，九年前之所以突然颓废也是因为黑羽盗一之死。
他告诉妃英理，当时他为了忘记黑羽盗一的死自我催眠，模拟了新的人格，这也是为什么后来变成那副样子。
而之所以记忆恢复是因为柯南和黑羽快斗。
毛利叔还说，他在这场决斗下定公开自己身份之前就已经做好离开的准备。因为他再待在这儿，只是徒增危险。
讲完这一切，两人都默认无语，而偷偷在妃英理身上放了窃听器的小兰被这样的过去以及之前就察觉的工藤新一喜欢父亲的事实击垮，彻底崩溃。
妃英理接到医生的电话和毛利叔紧急赶回医院。
在病床前，毛利叔跪在昏迷不醒的小兰面前忏悔。妃英理说毛利叔既然选择离开，那么以后都不再出现在小兰面前，她自己也将带着小兰离开日本。
毛利叔答应了，同时希望妃英理能到英国让小兰继承他的公爵之位。一方面是作为补偿，一方面也希望小兰能替他照顾年迈的威灵顿公爵的晚年。
毛利叔最终离开了，送行的人是独自前来的工藤优作。毛利叔坦言如今的自己真的把所有伪装揭下才彻底解脱了出来，之前一直徘徊于盗一的死并不是纯粹对盗一的爱，而是他对他自己的不能释怀。尽管最后他只能以这样的方式收场，甚至没有机会去补偿小兰和英理这些被他伤害过的人，但他有下半辈子去坦诚的忏悔罪孽去思念盗一。
工藤优作说如果九年前在中国碰到的毛利叔是现在这样的话，或许他会变成一个愚蠢的爱慕者。但他终究有家庭，毛利叔也不是现在的毛利叔。所以他现在可以平静的站在这里送行。
毛利叔想起九年前因为盗一之死，他独自去中国旅行时碰到工藤优作并发生露水姻缘的事，联系现在，两人最终只是互相报以释然的笑。
飞机，两人分别。
工藤优作离开机场的时候碰到赶来的黑羽快斗，黑羽快斗看着的飞机说自己会一辈子追下去，直到找到毛利叔。
几天后柯南醒来服下解药变回工藤新一，从优作口中得知毛利叔离开的消息失魂落魄。之后毛利兰被妃英理带到英国疗养，两人关系断绝。
工藤优作拜托灰原哀照顾工藤新一，两人结婚，但工藤新一一直念着毛利叔，却在家人的制止下和灰原哀做了一对表面上的夫妻。
数年后灰原哀心力交瘁，而工藤新一却想挽回这段婚姻，灰原哀提出离婚，两人从恋爱重新开始。
毛利兰在英国疗养了数年，最后和白马探成婚。
――end――