在人类的历史上，为了更好的生活于天地之间，人们一直制造各种工具，提高了生存技能，也提升了生活质量。
比如刀剑弓箭等武器的出现，让人类变得更强，有了与凶猛野兽正面博斗的能力，从而走出了山洞，生活在广阔的原野。
煲和锅的出现，提高了人类的生活质量，延长寿命，可以说，一直是科技在促进人类进步，但是无论在东方和西方，都有势力在压制科技的进步，在东方是儒家学派，在西方则是宗教。
科学与宗教在西方曾一度处于水火不容、你死我活的对立关系中，但是这种对立状态并非科学与宗教的全部关系。
而只是二者在一定历史阶段中所呈现出来的一种特定关系，正如它们曾经也在其他的历史阶段中呈现为一种水乳交融的同一关系一样。在西方历史中，科学与宗教的关系是一种动态的、随着时代的发展而不断调整和变化的关系。
比如现在，传教士们发现单纯的传教并不能帮助人们进步，吸引到其它人的兴趣，所以传教士们摇身一变，成为了多面手，在宣传科学的同时，也夹带了不少私货，所以他们与时俱进，活到了最后。
而儒家学派一直高高在上，固步自封，跟不上时代的脚步，最后被时代抛弃，跌落了神坛，回归学术本质。
米柱在大明最大的敌人，其实就是这儒家学派的仕林中人，他们为人顽固，思想保守，对其它学派，大加打压。
大明是仕农工商，读书人高高在上，农民和商人还可以通过读书晋级，工匠则是世代匠籍，没有出头的机会。
米柱利用厂卫系统的特殊性，提高了他们的地位，不过这依然是没有改变多少，后世的米帝，可是把工程师作为国家的根本，国家的核心。
米帝人口不是世界上最多的，但工程师却是最多的，这让他们科技发达，遥遥领先，傲视群雄，称霸世界，这一点是值得米柱学习的，他也决定走科技强国之路，目前在大明，根本做不到。
与其和这些人勾心斗角，斗一个你死我活，不如另起灶炉，建立新的国度，这也是米柱决定扬帆南海的原因之一。
这时代的大明人，依然认为大明是世界正中，是天朝上国，对于海外，一直视为荒蛮之地，现在许多人还认为海外就只有三座仙山、蓬莱、东瀛、方丈呀！坐井观天，那知世界之大。
连当朝精英叶向高等，都认为米柱封地，不过一州府之地，大是大了点，但是考虑到这么远，这就便宜了米家吧？这么的远，能不能抵达，能不能有效管理，这都是问题。
如果他们知道澳洲这么大，不在大明之下，如果他们知道澳洲这么大，南洋如此富饶，不知作何感想？但是有一点米柱可以确定，到了那一日，他己建立起足够强大的军队，可以保护他的利益不受侵犯，就是大明皇帝和朝廷反悔也没有用了。
因为大明最强的水师舰队掌握在了他的手中，而且他是有计划的剥离，这黑水舰队本来就是新建，朝廷在其中影响力不大，更有甚者，他们一向不听兵部和军机处的调令，只是听米利坚懂事会的，现在好了，米柱有意识剥离。
加上大明根本不重视海上权益，水师就是后娘养的，米柱乘机接管，水师尽入其控制之中。
米柱下南洋，看似是实力大幅倒退了，其实是转到了海上，有朝一日，这些官员会发现，大明海权，尽在米柱控制之中，只要米柱不同意，他们寸板不得下海。
这在现在，不是什么问题，大明本来就禁海，现在逐步开放，也不是多大的事，但到了那个海洋时代之时，就是欲哭无泪之时了。
米柱在担任南洋大臣之后，便开招公开的大张旗鼓，招揽人手，为他扬帆南海作准备。
在此时他收到了葡萄牙人和西班牙人兵分两路，进攻马尼拉的消息，米柱立即下令黑水舰队反击，乘机对荷兰人和葡萄牙人宣战。
当马尼拉在浴血奋战之时，李旦率领主力舰队南下，他坐镇宝岛，郑芝龙率部进攻马六甲，而颜思齐则在宿务甩开了葡萄牙舰队，与事先潜伏的舰队会合，进攻巴达维亚。
一百多年前，葡萄牙人占领了马六甲城之后，便将它打造成为东方的前进基地。
马六甲现在处于全盛时期，是个闻名于世的港口及经贸中心。由于其位置处于航海及经贸的中心，又有良好的深水港口，东去资源丰饶的东方文明古国，西接印度、阿拉伯世界及欧洲西方列强，使得马六甲不仅成为繁荣一时的商业中心，它也同时成为东西方多种文化互相碰面及交流的地方，大明朝的郑和在七度下南洋的时候，就是以马六甲为中转基地，他在这里设立了母港，建立了仓库。
马六甲可以看到马来人、华裔、葡萄牙裔聚居的街区，可以看到葡萄牙人修建的圣地亚哥城门和圣保罗教堂、最近才修建的总督府、阿拉伯风格的清真寺以及大明式庙宇。
马六甲在十六世纪大航海时代兴起前，成为东亚不折不扣的海洋城市。每年吸引好几百艘船只顺着季风前来贸易，大明人、印度人、阿拉伯人、欧洲人挤满了港口。从大明来的樟脑、丝绸以及陶瓷，从印度来的织品，菲律宾蔗糖，摩鹿加群岛的檀香、丁香、豆蔻等香料，苏门答腊的金子以及胡椒，婆罗州的樟脑，帝汶的檀香，以及马来西亚西部所盛产的锡，统统汇集到马六甲，再转运到世界各地，马六甲俨然是当时商品的全球集散中心。
葡萄牙人占领了这里，等于占领了一聚宝盆呀！这里成为了他们在南洋最重要的基地，荷兰人打了几次主意，这都无功而返。
葡萄牙人的军队不仅有来自本国的军人，还有不少欧洲的雇佣兵，还有大量当地人组成的步兵队伍，除了一支舰队外，他们还花费巨资修筑护城的城墙，并在总督府附近建造了坚固的堡垒卫城。
由于城市本身被流入马六甲海峡的河流分为两部分，所以这座带有清真寺的要塞本身还扼守这联通两处城区的沿海大桥。只有通过大桥和要塞的防御火力，船只才能进入安全的城市内港停泊。可以说马六甲城对于任何想要攻克他的敌人来说，都是一块难啃的骨头。
这是一座国际化大都市，城里云集了当地的马来人，印度的泰米尔人、孟加拉人和古吉拉特人，地中海和西亚来的土耳其人和亚美尼亚人，中南半岛上的越南人、泰国人和缅甸人，东面的文莱人和菲律宾人，甚至还有打破海禁政策南下的大明人。
当郑芝龙舰队出现在外海，造成了巨大的震动，乱成了一团，许多人都认为是海盗前来洗劫城市了。
郑芝龙是打着大明水师的旗号，但是这年头，兵和贼很难分开，况且这郑芝龙本来就是大海盗，穿上官服没多久，谁敢保证他不会脱下官服，干上一票，捞些外快和打秋谷？
郑芝龙让使者传来了宣战书。
葡萄牙马六甲总督阿齐兹惊得呆了，宣战！开什么玩笑？如果不是郑芝龙的舰队来了，还一字排开，升起了大炮，阿齐兹真的认为，有人是在开玩笑了。
阿齐兹一方面与郑芝龙谈判，另一方面则利用拖延的时间，组织军队准备抵抗。他的部下在内港入口上方的大桥上建立了防御用的栅栏，并在内港聚集起了一支舰队。
同时在马六甲城内的葡萄牙商人蛊惑下，准备对城市内部发起一次特殊的肃反行动，将可能不站在他一边坚持抵抗的非葡萄牙商人一网打尽。这样一来，不仅不少来自印度和东南亚地区的商人可能遭殃，连当时正在港内的十艘大明商船也不能幸免。
阿齐兹派人前来责问：“两国一向友好，为何突然开战？”
郑芝龙道：“你们攻击大明属国吕宋，这是对大明皇帝及大明朝廷的挑衅，必须承受大明的怒火。”
使者诡称：“吕宋还没有建国，大明还没有正式承认吕宋国，所以我等并不算攻击大明的属国。”
郑芝龙道：“这一点你们可以去北京，向大明皇帝陛下申诉，本官奉令攻打马六甲，挡我者死。”
使者道：“我们马上派使者去北京申诉，在此期间，你们不可以发动攻击。”
郑芝龙道：“本官的任务是拿下马六甲，尔等不投降，立即发动进攻，尔等后果自负。”
使者再三劝说，郑芝龙不为所动，只好灰溜溜的走了。
次日，经过大半天等待后的大明舰队发起了第一次攻击，他们几十艘大型战舰一字排开，对城市发动了炮火急袭，炸得马六甲城沙石横飞，烽烟四起。
葡萄牙人的舰队，主力己率贝尔格总督的舰队出征，剩下的小舰队，打打海盗，捉捉走私，维持治安尚可，要对付郑芝龙的大舰队，根本不是对手，才刚交战，他们就被击沉了一半，余者亡魂大冒，逃入了港湾之中，在跨河大桥上的炮台掩护之下苟活。