随着两人数次联络，耿仲明都表现的很真切，孙应龙真的以为耿仲明还认他这个兄弟，便告诉了耿仲明，只要他愿意接受招抚，并且干掉李九成或者孔有德的话，天津巡抚郑宗周郑大人就会上书朝廷，为他请功，不但不追究叛乱的责任，甚至还有可能升任副将。
耿仲明也将计就计，表示自己愿意归顺朝廷，自己其实并不想起兵作乱，都是被孔有德和李九成二人逼得，他早就想干掉这两人，然后继续为朝廷效力，现在有他孙老弟和郑巡抚做保，他一定配合，为朝廷立功。
但同时也表示，这件事情有些麻烦，虽然现在归自己节制的兵马很多，但这些人都是李九成的直属部下，自己倒是能诱杀李九成，但如果真的这么做了，那些兵马肯定会转过身来攻打自己，忠于自己的兵马没那么多，自己不一定没能打得过，所以他还有些顾虑。
对于耿仲明的这个顾虑，孙应龙非常贴心的表示，既然你耿老弟兵力不足，那么我作为大哥，目前手头又有不少兵力，完全可以协助你完成这件事情，到时候两兄弟一起升官发财，岂不美哉。
对于这个提议，耿仲明表示同意，随后，孙应龙就率领着全部的天津水师，一共六十多艘战船，接近四千士兵，开赴莱州湾，准备配合耿仲明，在诱杀李九成后，镇压其部下的反抗，一举平定这波及大半个山东的兵变。
三月十九日，孙应龙率领东江水师抵达了莱州湾，耿仲明为了取信孙应龙，还专门从阵亡的士兵里面，找了一个和孔有德长相有七八分相似的，经过一番处理，然后割下头颅，交给孙应龙派上岸的信使，说是已经诱杀孔有德，正在计划诱杀李九成。
孙应龙手下基本没人认识孔有德，但驻守芙蓉岛的彭友谟部水兵却有人知道，当初彭友谟上岸突袭，试图重回海上的计划失败后，就进了莱州城，但船队却还在莱州湾外面，孙应龙让他们协助辨认，本来这个头颅就很像，经过一番处理，如果不是非常熟识之人，基本上是不可能看出来是假的，他们一致认为，这就是贼首孔有德。
于是，完全相信了耿仲明的孙应龙，不疑有他，就率军登岸了，准备配合他一起，先杀李九成，再解决掉他的部众。
就在孙应龙见到耿仲明这个他十多年未见过的老友后，正准备寒暄几句，然后把酒言欢共商大事的时候，耿仲明却突然发难，挥动着戚刀砍向孙应龙。
尽管孙应龙对此毫无防备，但是多年刀口舔血生涯，让他本能的对这一击做出了反应，侧身躲避，这次闪避让他保住了性命，但他的左手却没能保住，整个手掌都砍掉了。
孙应龙的亲兵也对此毫无防备，但亲兵就是亲兵，他们立马挺身而出，将自己大人护在身后，耿仲明也在一击不成后，退到了亲兵后面，双方的亲兵展开了厮杀。
此时，孙应龙也知道自己这是上当了，中了耿仲明的轨迹，但他也没有那个闲工夫骂耿仲明背信弃义，马上撤退到战船船上才是正事，然而他发现身后也杀声四起，他们的退路已经被阻断了。
孙应龙忍受了剧痛，依旧在指挥着亲兵反击，试图杀出一条血路，然后撤回船上，但耿仲明如何会让他如愿，越来越多的士兵投入到了战斗中，双方的厮杀越来越激烈，但亲兵就是亲兵，孙应龙一方仍旧是顽强抵抗。
看着这小范围内僵持的战局，耿仲明却没有丝毫担心，因为他刚才的一击虽然没能杀掉孙应龙，但也不是毫无作用，而且他做了充分的准备，又有兵力上的优势，赢下这一场战斗是注定的。
果然，没过多久，没因为左臂被砍断，没有采取有效的止血措施，孙应龙不断地失血，最后意识模糊，轰然倒地，他的那些亲兵们又要对抗耿仲明的手下，又要照看倒地的主将，力渐不支，还是落败了。
看着倒在地上昏迷不醒的昔日老友，耿仲明心中没有哪怕一丝丝的怜悯，直接挥刀砍下了他的头颅，然后让人高举头颅，传首整个战场，用于震慑还在反抗的明军官兵。
天津水师的士兵们，本来就被突如其来的攻击打的懵了圈，完全是凭着本能在抵抗，此时又看到自家主将被人杀了，哪里还有心情反抗，除了一开始就被杀掉的，以及誓死反抗的，其他的水师官兵都选择了投降。
就这样，耿仲明成功的俘获了整个天津水师舰队，整个战斗过程连一炷香都不到，耿仲明这边的损失也是微乎其微，也不知道是耿仲明的计策太好，还是孙应龙太蠢。
此战俘虏的天津水师官兵和水手，加起来有两千多人，但是对于孔有德来说，这些俘虏的士兵没什么，让他眼热的是天津水师的战船，足足有六十多艘战船啊。
可以说，这些战船已经算是天津水师的大部分家当了，现在人没了，船也没了，天津水师可以说是名存实亡了，就算是想重新组建天津水师，也不是短时间内能办到的。
大明水师的战船，大部分都是福船，而且按照大小区分等级，其按大小和用料的不同，依次分一号大福船、二号福船、三号草撇船、四号海沧船、五号开浪船、六号快船等六个等级。最大的一号大福船排水量约在五百吨左右，二号和三号也分别在三百吨和两百吨。
这次耿仲明俘获的战船里面，一号福船一共五艘，二号和三号福船超过了四十艘，最小的也是四号海沧船。、
孔有德对这些战船眼热不已，如果有了这些战船，他完全可以在解决掉吴安邦后，抽调兵力，乘坐战船度过渤海海峡，支援正在旅顺与黄龙鏖战的陈有时和毛承禄，然后拿下整个旅顺，从而在辽东站稳脚跟。