袁崇焕又列示了觉华岛死难者的名单，并向皇上介绍西虏蒙古中有部落趋建虏入侵之际，暴起发难，明军奋起反击，双方之间也发生了战斗：”其觉华岛败而死忠足录者，姚与贤、李士登、王锡斧、王鳌、李一葵、张其性、翟继皋、徐国蕃、金冠、金士麒与中千把诸人俱当录者也。计上首虏至二百六十有九，皆得其名，系降夷与回乡所识认者。西虏乘隙肆暴，邀绝吾商贾，掳掠我堡军；我军极力逐杀，割首级亦一百一十五颗，功亦非细。“
袁崇焕也承认此仗并非全胜，觉华岛兵之丧者七千有余，百姓男妇杀戮最惨，与河东堡、笔架山、龙官寺、右屯之粮，无不焚毁，其失非小：”但此番奴氛甚恶，攻宁远不下，始迁戮于觉华；倘宁远城不保，势且长驱，何有于一岛哉且岛中诸将，金冠先死，而姚与贤等皆力战而死。视前此奔溃逃窜之夫，尚有生气。金冠文之子会武举金士麒，以迎父丧出关，闻警赴岛，遣其弟奉木主以西，而率义男三百余人力战，三百人无生者。其忠孝全矣，今宜厚恤者也。“
至是，兵部尚书王永光议奏：”恢边胜算，以宁远为第一功，而灭奴要会以叙宁远为第一务，文武将吏从此立为脚，富贵功名从此发轫。皇上深嘉清野坚壁之伟伐，酬报于前，而姑免失粮弃岛之深求，策励于后，将有功大小文武诸臣论功升赏，以普皇仁。伤亡军丁照例议恤，并将失事在逃者正法革职，庶功罪不淆而激劝无穷矣。“
天启皇帝知道这就是给宁远之战最后下一个官方的结论，虽然宁远一战明军被动防御，并未杀伤建虏主力，而且军粮损失不少；但是，天启皇帝觉得袁崇焕所说的“建虏势且长驱，何有于一岛哉”有道理，此一战粉碎了建虏不可以战胜的神话，也挫败了努尔哈赤试图速胜明朝的野心，于是欣然诏曰：”宁远挫贼，恢复有机，朕心嘉悦。内外文武各官，功既经勘明具覆，宜加褒叙。“
就在朝堂上下为宁远之战的胜利感到欢欣鼓舞的时侯，毛文龙却来扫皇上的兴致，他第二次上表请释旧日广宁巡抚王化贞，极言王化贞为辽人所击心，西虏亦乐于助顺；称引哥舒翰事，愿将海外历受官阶一一归还朝廷，以赎王化贞之死，策令自效。
天启皇帝知道王化贞当年提拔过毛文龙，算得上对他有知遇之恩，为王化贞求情也算得上人之常情；但是天启皇帝心中始终有根刺：当初在宁远之战之前，自己曾经飞骑传与毛文龙让他袭后捣巢。还说果能灭贼雪耻，朕不吝通侯之爵，以赉劳臣的厚赏；然而，宁远之战时，自己也未听说毛文龙采取过什么行动，如今，他不提自己采取了什么行动，反倒给王化贞这个半截入土的罪人求情。
天启皇帝越想越怒，于是下诏谴责毛文龙牵制的作用在那：“功罪原分两途，信赏必罚，系朝廷操柄。毛文龙即使有功，岂得代人赎罪况奴酋入犯，文龙全不知觉，牵制安在辄敢言功，乃为失陷封疆之人求宥，藐视朝廷，是何法纪念海外孤军，姑不究。”
袁崇焕趋势提议让毛文龙宜檄居近岛，侦奴虚实，官减兵减，饷力自饶；兵部尚书王永光覆袁崇焕疏言：毛帅与朝鲜近，与奴酋远，姑留以为虚声。
蓟辽总督王之臣在这件事上也翻了糊涂，他竟上疏为王化贞求情：“毛文龙僻居海岛，人颇疑其无实。今登抚隔海，既难遥制，若另以文臣监督，又恐势不相能。查毛帅原出罪抚王化贞门下，尝上疏愿为化贞赎罪。不如暂缓化贞一死，出令戴罪监其军，浮海办贼，限以三年。成则论功，不成则原案具存。”
天启皇帝也把王之臣痛斥了一顿，质问他还想不想当封疆大吏了：“不问奴势缓急，战守之具自当作速料理；王化贞屡奉严旨，窦承武逃将情真，祖宗法度昭然，何必会议况封疆之臣，岂得为失陷封疆者求宥”
毛文龙没摸准皇帝的脉，又把天启五年的旧账翻出来请功，并请拔粮饷救济：“参将易承惠等，于天启五年九月二十七日带领兵马二千余员名，过江远击鞍山、甘泉铺等处。于十月初三日夜走至八寨会，围住鞑贼，喊炮烧房砍杀，在阵活抢真夷鸣啼等二十九名、夷妇一口，阵亡官兵何应元等五十三名，章下兵部。奴酋近边射猎，挑选披甲，办作城梯、牛车、粮草，要西来攻抢。已行将官林茂春、王辅等，带领官兵相机暗袭，或攻城牵掣。乞多发粮饷接济。”
随后，毛文龙又上一疏，这次总算提到天启六年之事：“奴酋近边射猎，挑选披甲，办作城梯、牛车、粮草，要西来攻抢。已行将官林茂春、王辅等，带领官兵相机暗袭，或攻城牵掣；乞多发粮饷接济。
兵科给事中薛国观见天启皇帝最近对毛文龙意见很大，于是找准了机会，告了毛文龙一状：“顷接登莱巡抚李嵩塘报一揭，内称天启六年三月二十日，准平辽总兵毛文龙揭前事，天启五年据前哨中军杨祖宁、千总王国仁、召首杨承高等回称，探得止有千人八会寨，许多鞍马齐备，鞑贼各屯并不见鞑子走动等情。职等急统各营，潜行星飞前进，于初三日夜走至二更时分，官兵齐至八会寨，围住鞑贼，知风抵敌，官兵奋勇，喊炮烧房，砍杀许多，余贼跑散。“
”该职看得奴酋蛰伏数载，海外自信牵制之能，朝中亦推牵制之力，臣愚窃意其或然。不虞今岁正月，奴拥大兵入犯，几于倾巢，虽是稍挫其凶锋，而攻围屠掠、逍遥内地者直二十有日，略无踉跄返顾之意。迨班师而东，操演沈阳，伏图再至，一似不知有牵制者。然兹续塘报，尚叙去年十月间事，其于大举入犯越两月余，概乎未闻，真风马牛不相及，犹且曰侦探最真、朝谋夕计、闻风扑杀者耶“