故事发生在千万年前的洪荒大战时期，那时的黄花村，还是片人烟罕至，干旱荒芜的土地，没有一丝金黄，也没有半束黄花。
直到有日，一颗通体发亮，晶莹剔透的翠绿珠子从天而降，落入这片贫乏干枯的大地之上。
那珠子很美！黄花村的先祖---罗氏，一直把它当作世间罕有的夜明珠，点缀在那片只有杂草与泥土的大地中央。
随着时间飞逝，这颗翠绿珠子是越发的明亮璀璨，有一天，它还有了生命，将围绕自己周围的土地浸润得异常的肥沃与湿润。
原本寸草不生的地里，转眼长满了一朵又一朵金黄金黄的油菜花。
罗氏见到这景象，不由大吃一惊，于是唤来全村的人民，对这珠子又是扣头又是跪拜，每日如此，从未间隔。
光阴似箭，日月如梭，百载之后，在这肥沃的土地上，一个富饶美好的村落应运而生，它是罗氏一脉的黄花村。
在绿色奇珠的庇护下，黄花村的人安居乐业，过着幸福无忧，安逸自在的日子，然而快乐的时光总是有限，辉煌的历史总有瑕疵。
不知从何日开始，那颗发着亮芒的珠子，忽然逝去了往日翠绿的耀光，取而代之的，是珠子上不断渗出的一股股乌黑粘粙的液体。
渐渐地，乌黑粘粙的液体在黄花村蔓延开来，使得原本富有生机，富有活力的村落失去往日的风采，触到黑夜液体，金黄的油菜花立时褪去金色的外衣，化为一堆枯枝，触到黑色液体，金黄的稻谷顿时伏下磊磊硕粒的头部，从此不再生长。
耀眼绿珠是黄花村世代相传的镇村之宝，它给村里带来的，一直是繁荣与美好，而现在，却是凄凉与祸害，这黑漆漆的液体使黄花村失去往日的金黄与欢闹，使黄花变得一片死寂与紫青。
望着村子一天天衰败下去，黄花村的村民都茫然迷惑，不知所措。
直到有一日，村里来了个老者，老者苍颜白发，望上去鹤骨仙风，他满脸庄重地告诉村里的人，这颗绿色珠子是颗龙魂，不能多见生人，生人见多了，便会反噬，若要村里恢复正常，只需修建一个地下迷宫，将珠子藏于深处。
听得老者的话，村里的人不敢迟疑，马上动起工来，等迷宫完成之后，那老者拿起一枚普通的扫帚，在空中乱舞了一阵，就欣然对众人笑道：“日后，你们罗氏的血与这迷宫就连为一体了，只要你们守持正道，迷宫下的珠子便会永远祝福你们黄花村。”
村民见老者既会腾空，又会幻术，以为仙人下凡，拯救苍生，不由全跪了下来，扣起头，谢起恩，那老者拨弄下长须，摇了摇头，说道：“你们从此不得与外世来往，需代代保护龙魂，等有缘人的到来！今日之事，只要你们守口如甁，非罗氏一系不语，那么黄花村日后必定无忧，永保太平！”
这便是黄花村的秘密！这秘密世代相传，已厉千载。不过随着时间的飞逝，社会的进步，秘密却越来越得不到人的重视，很多年轻人将它当成一个无稽的传说，有的还耻笑祖先的愚昧与无知。
终于有日，一个到城里读书的孩子按捺不住内心的逞强，将这秘密吹嘘着道了出去：“喂，你们知道么？我家乡有颗龙珠！”，谁也没想到，就这小小一句话，导致的，却是黄花村数千人永无安宁的日子。
白莲圣地的建立，络绎不绝的寻珠人，村民的软禁……黄花村从此厄运连生，违背一个承诺，换来的是百载的沧桑与焦虑，黄花村的秘密，是一份可怕的责任！
这些，琉璃一直没敢忘记。
琉璃是不会把这些事告诉罗送仁的，她什么也不会说，因为她爱他，她不想把他拖入这趟浑水，不想他过着肩负重担的生活。
“快告诉我，告诉我黄花村到底有什么秘密？你知道，我是不会让你走的，我说过，不管发生什么事，我们都要在一起，琉璃，这……这你也答应过我呀！”罗送仁眼神锐利，望住琉璃，琉璃欲张的嘴还是合上，她没有答他。
直至良久，“再见了，送仁！”琉璃微微一笑，带着不舍与哀伤，将真气运于掌心，朝罗送仁轻拍而去。
受到毫无征兆的一击，罗送仁没了幽魂蓝光的庇护，根本抵挡不住真气的侵蚀，身子霎时软了下来。
“为什么？为什么？不是说好一起面对的吗？为什么？为什么要丢下我，为什么？”疑问与伤感在他脑中飞舞着，他正想说出这句话，但才张口，眼皮已无力支撑。
“扑通”他合上迷糊双眼，重重倒在了地上，渐渐地，金黄的衣裳，黑色的短裙，乌黑的长发，琉璃玲珑的身影，从他瞳孔中徐徐逝去，化作一片无休止的黑夜。
望着晕厥的罗送仁，琉璃的心很痛，她知道，她不应该丢下他，不应该离他而去，不应该违背她俩间的诺言，可是，在爱面前，这种种的不应该却又成了种种的应该，应该独自承担族人的重担，应该为他而离开，应该让他过上更幸福安逸的生活。。
在爱面前，承诺与生命都显得一文不值，在爱面前，只有对方才是那心中的唯一。
纤纤素手拭去他脸上积满的尘埃，琉璃蹲在罗送仁身旁，啜泣道：“送仁，对不起，对不起，我不能遵守我们之间的承诺了，你说我自私也好，说我任性也好，这么多年来，我都听你的，都顺着你，这次我也想听你的，也想顺着你，可是真的不行，我做不到，我真的做不到。你就容我自私一次，任性一次，好吗？忘了我，以后好好活下去，找个更好的姑娘，好好地活下去。”