丰臣秀吉颁布伴天连追放令，旨在打压天煮J徒，而非完全禁止。旨在将所有传J士驱赶，并限制耶苏会的特权，以此控制J徒的数量。而倭国全面禁止天煮J要到1614年1月，当时德川幕府已经建立。
被勒令离开的传J士抱怨无船回果，丰臣秀吉又将传J士离开的时限延长了六个月。经过一番整治，此时在倭国的传J士还剩300余人，各地的J会学校，J堂等传J场所仍有250个。
丰臣秀吉虽没有像后面德川幕府那般血腥镇压天煮J，但仍有不少J徒被杀。后来的天煮J禁令愈发严厉，稍不遵从禁令者，就会惨遭杀戮。至1590年，即追放令颁布三年后，被杀戮的天煮J据估计达两万多人。
那座号称“任何一个倭国大名都无法攻破”的长崎要塞被丰臣秀吉一声令下拆除；有些“漂”的科埃略后来为了不惹怒丰臣秀吉，不再身穿欧洲服饰，而是改穿倭国服饰，且不敢公开传J，一直偷偷摸摸的进行。直到1590年，其病逝在肥后加津佐。
至于丰臣秀吉为何没有彻底禁绝天煮J，有人揣测其仍需要传J士来沟通葡萄牙和西班牙。
海贼禁止令初令与伴天连追放令的推行，前者或许是为了针对所谓“不限大唐、南蛮并诸商売船”，适用于从事无差别海贼、盗贼行为的深堀氏；而后者有着以保护南蛮贸易为内容的“特许状”的性质。两条法令毫无疑问的彰显了丰臣秀吉为实现掌控海外贸易、收归各地外务大权的雄心。
（注：深堀氏是肥前豪族，一直活跃在博多沿海一带，与称霸濑户内海的村上氏一样，是个势力庞大的海盗团伙。村上氏几乎支配了整个濑户内海，在重要的场所建构了很多的城寨。收取通行船只的关税，征收被称作“帆别钱”“驮别钱”的通行费。相对的，村上氏会给予“过所旗”，保障通行的安全。1586年，从堺港出海，向着濑户内海航行的葡萄牙人传J士路易斯·弗洛伊斯，在其所著中写道：“那个岛上（艺予诸岛）居住着倭国规模最大的海贼，筑有庞大的城寨，许多的部下拥有领地与船只，他们在这一区域有着强大的势力”。路易斯·弗洛伊斯评价村上武吉为“倭国规模最大的海贼”。丰臣秀吉颁布海贼禁止令初令，剿灭海盗是其次，将其船只、水手收入麾下，充作“海军”才是主要目的。）
不过法令推行带来的“短期阵痛”不可避免，那帮“南蛮人”表面一套暗地里一套，丰臣秀吉还是有所知晓的。因此，他对扩大其他贸易途径相当重视，一方面准备筹划颁布“朱印船”正策，鼓励扶持倭国商人走出去；另一方面也在积极拉拢传统唐商、李朝商、以及近几十年来忽然崛起的宋洲商人。
关于宋洲商人是否要划入“南蛮贸易”的范围，丰臣秀吉有过一阵考虑。宋洲商人虽与明朝商人无异，但两者行为举止、思考方式截然不同，而且宋洲商人背后有一个强大的朝廷在撑腰，不像分散的唐商那样好对付。
尽管宋洲人没少干G卖人口的事，但据下面人反应，那些流落出去的倭国百姓日子过得还不错，不像是在南蛮人手下只能充当奴隶。更主要的是宋洲人对传J并不热衷，对商业利益比较看中，宋洲商人手里既有倭国急缺的生丝、瓷器，也有火枪火炮、战马盔甲，这些丰臣秀吉看中的好东西。所以丰臣秀吉最后还是将宋洲商人划归到了唐商的一个分支。
令丰臣秀吉感到有些恼火的是，宋洲商人对于己方的拉拢并不热情，在其还未开启九州征伐时，他们就将商业网撤走，现在活跃在九州的只有其下级代理商。对于宋洲商人的这种反常态度，丰臣秀吉实在难以理解。
其实感到匪夷所思的，不止有丰臣秀吉，原长崎商站的一帮人对上面外务部的决定也难以理解。你说担心九州动乱提前撤走好说，现在九州已趋于平稳，为何还不恢复商站？
丰臣秀吉对攻打李朝与明朝的想法已不加掩饰，曾不止一次与身边家臣，还有如科埃略这样的外邦人提及，甚至他已经命人开始收集有关李朝与明朝的情报。
果家智库的一帮人可不认为丰臣秀吉的想法是妄想，在经过缜密推演后，所有人一致确定历史上的壬辰倭乱不可避免。
在九州征伐取得成功后，丰臣秀吉的对手只剩一个北条氏，其一统倭国是早晚的事。战事即将平定，一大帮冲锋陷阵的武士即将失业，不给他们找条出路，看管起来，这帮人可不会安分守己。历史上1588年，丰臣秀吉便意识到涩会动荡的潜在可能，随即下达“刀狩令”，禁止百姓拥有长短刀、长枪、火枪等武器。当时的乡村究竟拥有多少武器，这从加贺国江沼郡所没收的武器即可一窥端倪：武士刀一千七百零三支、腰刀一千五百四十支、长枪一百六十支、耙刀五百支、小刀七百支。另外出羽国仙北郡则没收武士刀二百五十支、腰刀二千七百三十支、长枪三百三十六支、火枪二十六支、弓七十六把、盔甲十二具、头盔五顶。
百姓好治理，但散落的浪人、破产的武士就没法控制。小田原会战（1590年）以后，天下平定，没仗可打，曾经追随主公东征西讨的武士们许多沦落为浪人，整日游手好闲。此外功臣和归降大名的封赏问题，也令丰臣秀吉十分头疼。土地有限造成了分封不均，这又引发了新的矛盾。一些大名怀着领土扩张的鬼胎，摩拳擦掌，跃跃欲试，企图给刚刚安稳的秩序加点“佐料”。
在丰臣秀吉看来，似乎只有对外的战争，才能获取更多的土地，方能平息武士与领主的不满。而通过出兵打仗，不仅能暂缓大量失业武士的窘境，还能借机削弱地方“诸侯”的有生力量。
既然历史上的壬辰倭乱不可避免，果家智库自然不会让下面人往火堆里跳，而是要谋划更大的一场好戏。