战争爆发后，就像奥斯曼帝国认为的那样，希腊軍队确实不是他们的对手。
马尔马拉海战之后，希腊海军遭受重创，国王进行紧急动员，将能用于作战的武装商船都征集起来，可依然不是依靠雄厚实力打造出来的奥斯曼帝国海军的对手，这本就不是一场公平较量，一个是人口百万左右的希腊，一个是人口5000万的奥斯曼帝国。
通过收缩海军，依托近海防御工事，希腊在海上勉强能够保护自己的海岸。但在陆地上就没有办法了。
对奥斯曼帝国宣战，不但是国王的意愿，更是所有希腊地方实力派的意愿，因为奥斯曼帝国断绝了他们赖以生存的海运。如果说希腊有不愿意开战的地方派系，那就是北方的伊庇鲁斯和塞萨利两个地区，不是奥斯曼帝国的封锁政策没有影响他们的生存，而是一旦开战，他们将承受绝大部分压力。
此时的希腊，跟后世的希腊相比，国土大概只有一半左右，仅仅占有伊庇鲁斯南部，色萨利地区和以南地区，这意味着一旦开战，伊庇鲁斯和塞萨利将成为地面战争的前线，整个希腊都无力跟奥斯曼帝国对抗，更别说两个小小的地方实力派了。所以他们之前反对战争，在国民会议上，争论不休。最后在其他各地以及国王保证用全部陆军力量支持两地后，他们才同意向奥斯曼帝国宣战。
其实即便得到这些承诺，希腊人也不看好依靠自己的力量就能够对抗奥斯曼帝国，他们寄希望于欧洲列强的干涉，不跟奥斯曼帝国宣战，他们会直接损失黑海贸易，对比英国、荷兰都更依赖海贸的希腊来说，这意味着慢慢死亡，一旦宣战，他们还有可能像独立战争时期一样，得到欧洲列强的支持，最后也许会打破奥斯曼帝国的封锁，至于胜利，此时即便是最乐观的希腊人也没有信心。
北方两区希望能够依靠整个希腊的力量，将奥斯曼軍队挡在边境地区，然后等到欧洲列强的干涉。可惜其他各地的承诺是好的，但能否做到，什么时候做到，这些就不是两区能够决定的了。
结果开战后，奥斯曼四万大军长驱直入，从北方的马其顿地区、色雷斯地区，甚至阿尔巴尼亚地区攻入希腊北方，全都由北方两个地方实力派对抗，其他各区，甚至国王的軍队都迟迟赶不过来，让他们伤亡极为惨重。
两区代表在国民会议上十分不满，天天催促国王协调各区出兵。国王要求临近的西希腊和中希腊大区立刻支援，但两区各种借口，观望态度很明显。地方派系，说白了就是军阀，是军阀当然会有保存实力的念头，在大是大非面前，容易打自己的小算盘。
结果贫弱的伊庇鲁斯只定当了十八天，塞萨利也只多坚持了五天时间，此时国王的軍队已经出动，刚刚进入中希腊地区。
伊庇鲁斯和塞萨利地方派，跟奥斯曼帝国签订了协议，奥斯曼帝国保护他们利益的情况下，他们再次宣布向奥斯曼苏丹效忠，反正这些地方派系，过去就是为苏丹收税的走狗，投降奥斯曼帝国，不过是回归了他们的本来角色。
但今时不同往日，民族主义在整个欧洲传播。通过独立战争，希腊的民族主义又得到了进一步加强，“希腊人”的身份认同在这十来年中，已经在新一代的心中扎根。过去地方派系因为利益跟中央互相掣肘，对许多本地人来说，因为他们也能享受到这种保护利益，所以他们默认了这种现状，甚至有些地方派的知识分子公开宣扬地方自治才是希腊传统精神，作为世界文明中心的希腊，不需要从后辈的西欧学习他们的制度。
但这一次，地方派系的这种投降行径，引起了整个希腊的愤慨，连他们自己的知识精英都背弃了他们，再也没有人为这种分裂割据的现状洗地了，分裂就是分裂，一盘散沙就是一盘散沙，不管如何粉饰，在巨大的压力面前，都是沙丘堆砌的城堡，不堪一击。
北方两区的投降，让其他四个区的代表很愤怒，将两区代表从国民会议上赶了出去。
然后四区开始认真商讨联合防御的协调问题，大家表面上承认国王是所有軍队的统帅，可全都不同意交出军权，让国王统一指挥，在各种扯皮中，前线继续溃败。
西希腊和中希腊大部被奥斯曼軍队攻占。此时抵抗实力就剩下了伯罗奔尼撒半岛、雅典区和埃维亚岛了。其中伯罗奔尼撒半岛西北部属于西希腊、埃维亚岛属于中希腊，名义上四个区的联合抵抗还没有结束，可实际上抵抗的中坚只剩下伯罗奔尼撒和雅典区了。
这两区一直都是希腊最强大势力，早在古希腊时期，雅典同盟和斯巴达同盟以两地为根基，都各自拥有数十万人口和数万軍队，可惜到了现代，两地人口反而下降了，雅典区人口过去只有二十万，这几年国王鼓励工业，吸引移民，才让雅典区人口增加到了三十万人。
所以雅典区是最强大的，国王又利用自己的地位优势，组建了一支两万人的軍队，而伯罗奔尼撒地方势力只有一万出头的軍队。
最明智的选择，现在伯罗奔尼撒应该积极支持国王，将自己的武装力量交给国王指挥，从而更容易包围剩下的国土。可惜的是，伯罗奔尼撒依然拒绝国王指挥他们的地方軍队。原因很简单，占领中西希腊之后，奥斯曼帝国大军下一步肯定是先进攻雅典，要攻打伯罗奔尼撒，必须通过科林斯地峡，不攻占雅典，奥斯曼軍队是不可能抵达这道地峡的。这道地峡是一座天险，历史上希波战争中，斯巴达人就是在这里击败了不可一世的波斯大军的。
战争的失利，让伯罗奔尼撒地方实力派变得更加偏执和有恃无恐，他们甚至开始怀疑国王的能力。他们认为中西希腊的丢失，国王应该负重要责任。因为根据战争的情况，国王的軍队是第一个撤离的。反倒是当地武装坚持到了最后，毕竟人家是保家守土的。根据这种情况，伯罗奔尼撒代表表示，他们无法将本地軍队交付一个一个不肯为伯罗奔尼撒战斗到底的势力指挥。
周成功并不否认中西希腊的撤退，政府军是率先撤退的，而且是奉了他的命令。周成功一开始确实有借奥斯曼帝国之手铲除地方派系的想法，可那是在刚开始；看到奥斯曼帝国軍队确实比希腊軍队强大的现实之后，在保卫中西希腊的战斗中，政府军作战是相当卖力的，排除了一万三千軍队，伤亡了三千多人。奈何总体实力差距太大，奥斯曼的軍队已经增加到了八万，这几乎是整个希腊人口的十分之一，在技术水平、装备水平差不多，甚至奥斯曼軍队还略好的情况下，几乎很难阻挡住对方。所以周成功最后下令撤退，保存有生力量。
不是他有私心，覆巢之下无完卵的道理他还是懂得，铲除地方派系很有必要，但不能因此丢失了整个希腊。所以伯罗奔尼撒人的指责没有道理，但却也是事实。
周成功懒得边界，组织雅典保卫战才是正经道理。经过这段时间的政治运作，残存的中西希腊势力，已经愿意接受国王的整编，他们在伯罗奔尼撒西北部和埃维亚岛上的軍队，全都撤到希腊境内接受重新整编，然后在国王的旗帜下保卫雅典。
整合地方派系的力量，让周成功的軍队恢复到了两万人，但跟奥斯曼大军相比，差距依然很明显。
但这段时间，周成功在外交方面并没有闲着，战争爆发之后，他迅速展开外交行动。法国、俄国都愿意支持希腊，给予了大量的军事援助，除了提供大量武器援助之外，还以个人名义派出了一些“退伍军官”来希腊做顾问。尤其是俄国，黑海沿岸古代就有大量的希腊殖民地，以希腊语为官方语言的东罗马帝国时期，黑海沿岸都在东罗马的统治之下，东罗马帝国灭亡也不过几百年时间，因此黑海沿岸有大量的信奉希腊正教的希腊侨民。
其中许多侨民在俄军中服役过，甚至许多人都拥有俄国贵族头衔，比如领导希腊起义的友谊社领袖中就有大量这种身份的人。比如率先组织起义的依普希兰狄斯，就长期在俄国外交部门工作。
这些“志愿兵”的到来，大大加强了希腊軍队的力量，让希腊軍队总兵力达到三万人，虽然跟奥斯曼帝国的軍队数量相比差距还是很大，可依托有利地形渐渐阻挡住了战线越来越长的奥斯曼帝国軍队。
不过此时奥斯曼帝国依然认为胜利十拿九稳，他们只是因为希腊过于复杂的地形，导致运输给养暂时的困难，只需要对峙几个月，等待给养和新的援军到来后，他们就能发动新的战争。
周成功也不满足第一次成功挡住了奥斯曼大军进攻的局面，事实上他一直在计划反攻，一个他等待已久的消息终于传来了，满清帝国出兵了！